Το (Un) συνηθισμένο ύποπτο μυθιστορήματος προέλευσης νυχτερίδας Coronavirus

A πρόσφατη μελέτη προσδιορίζει ο μυθιστόρημα coronavirus υπεύθυνο για την επιδημία πνευμονίας στην επαρχία Hubei της Κίνας- ο ιός προέλευσης νυχτερίδας σχετίζεται με άλλους γνωστούς παθογόνους κορανοϊούς

Η 2019 Το νέο coronavirus (CoV) προκαλεί θανατηφόρα πνευμονία που έχει στοιχίσει πάνω από 1300 ζωές, με περισσότερες από 52000 επιβεβαιωμένες περιπτώσεις λοίμωξης από 13 Φεβρουαρίου 2020, όλα σε διάστημα μόλις ενός μήνα. Αλλά, τι είναι αυτός ο ιός; Είναι εντελώς νέος ιός; Από πού προέρχεται; Επιστήμονες από κορυφαία ερευνητικά ινστιτούτα στην Κίνα συνεργάστηκαν για να απαντήσουν σε αυτά τα ερωτήματα και αυτή η πρωτοποριακή μελέτη δημοσιεύθηκε στο Κινεζικό ιατρικό περιοδικό.

https://www.youtube.com/watch?v=jFKWluuMdgs

Στις αρχές Δεκεμβρίου, λίγοι άνθρωποι στην πόλη Wuhan στην επαρχία Hubei της Κίνας άρχισαν να αρρωσταίνουν αφού πήγαν σε μια τοπική αγορά θαλασσινών. Έζησαν συμπτώματα όπως βήχα, πυρετό και δύσπνοια, ακόμη και επιπλοκές που σχετίζονται με το σύνδρομο οξείας αναπνευστικής δυσχέρειας (ARDS). Η άμεση διάγνωση ήταν πνευμονία, αλλά η ακριβής αιτία ήταν ανεξήγητη. Τι προκάλεσε αυτό το νέο ξέσπασμα; Είναι το σοβαρό οξύ αναπνευστικό σύνδρομο (SARS) -CoV; Είναι το αναπνευστικό σύνδρομο της Μέσης Ανατολής (MERS) -CoV; Όπως αποδεικνύεται, οι επιστήμονες είχαν πραγματοποιήσει μια μελέτη για τον εντοπισμό αυτού του ιού τον Δεκέμβριο μετά την ανάλυση των πρώτων περιπτώσεων. Αυτή η μελέτη δημοσιεύθηκε τώρα στο Κινεζικό ιατρικό περιοδικό και η ταυτότητα του ιού έχει τεκμηριωθεί - είναι ένας εντελώς νέος ιός, που σχετίζεται στενά με το CoV που μοιάζει με SARS. Ο Δρ Jianwei Wang (Κινεζική Ακαδημία Ιατρικών Επιστημών, Ινστιτούτο Βιολογίας Παθογόνων), επικεφαλής ερευνητής της μελέτης, δηλώνει:Η εφημερίδα μας έχει αποδείξει την ταυτότητα του CoV προέλευσης νυχτερίδας που ήταν άγνωστη μέχρι τώρα."

Σε αυτήν τη μελέτη, επιστήμονες από γνωστά ερευνητικά ινστιτούτα στην Κίνα, όπως η Κινεζική Ακαδημία Ιατρικών Επιστημών, το Ινστιτούτο Βιολογίας του Παθογόνου, το Νοσοκομείο Φιλίας Κίνας-Ιαπωνίας και το Ιατρικό Κολέγιο Peking Union, από κοινού ανακάλυψαν και αναγνώρισαν το νέο CoV - τον κύριο ένοχο το ξέσπασμα του Wuhan - με αλληλουχία επόμενης γενιάς (NGS). Επικεντρώθηκαν σε πέντε ασθενείς που εισήχθησαν στο Νοσοκομείο Jin Yin-tan στο Wuhan, οι περισσότεροι από τους οποίους ήταν εργαζόμενοι στην αγορά θαλασσινών Huanan στο Wuhan. Αυτοί οι ασθενείς είχαν υψηλό πυρετό, βήχα και άλλα συμπτώματα και αρχικά διαγνώστηκαν ότι είχαν πνευμονία, αλλά άγνωστη αιτία. Η κατάσταση ορισμένων ασθενών επιδεινώθηκε γρήγορα σε ARDS. ακόμη και ένας πέθανε. Ο Δρ Wang λέει:Οι ακτινογραφίες στο στήθος των ασθενών έδειξαν κάποιες θολές αδιαφάνειες και συγκεντρώσεις, οι οποίες είναι χαρακτηριστικές της πνευμονίας. Ωστόσο, θέλαμε να μάθουμε τι προκάλεσε την πνευμονία και τα επόμενα πειράματά μας αποκάλυψαν την ακριβή αιτία—Ένα νέο CoV που δεν ήταν γνωστό πριν."

Για τη μελέτη, οι επιστήμονες χρησιμοποίησαν δείγματα υγρών βρογχοκυψελιδικής πλύσης (BAL) που ελήφθησαν από τους ασθενείς (το BAL είναι μια διαδικασία στην οποία αποστειρωμένο υγρό μεταφέρεται στους πνεύμονες μέσω βρογχοσκοπίου και στη συνέχεια συλλέγεται για ανάλυση).

Πρώτον, οι επιστήμονες προσπάθησαν να εντοπίσουν τον ιό με προσδιορισμό αλληλουχίας γονιδιώματος, χρησιμοποιώντας την τεχνολογία NGS. Το NGS είναι η προτιμώμενη μέθοδος διαλογής για τον εντοπισμό άγνωστων παθογόνων, διότι εντοπίζει και αποκλείει γρήγορα όλους τους γνωστούς παθογόνους μικροοργανισμούς στο δείγμα. Με βάση την αλληλούχιση του DNA / RNA από τα δείγματα υγρών BAL, οι επιστήμονες διαπίστωσαν ότι οι περισσότερες από τις ιογενείς ενδείξεις ανήκαν στην οικογένεια CoV. Στη συνέχεια, οι επιστήμονες συγκέντρωσαν τις διάφορες «αναγνώσεις» που ανήκαν σε CoV και δημιούργησαν μια ολόκληρη γονιδιωματική ακολουθία για τον νέο ιό. Αυτές οι αλληλουχίες ήταν 99.8-99.9% παρόμοιες μεταξύ όλων των δειγμάτων των ασθενών, επιβεβαιώνοντας ότι αυτός ο ιός ήταν το κοινό παθογόνο σε όλους τους ασθενείς. Περαιτέρω, χρησιμοποιώντας ανάλυση ομολογίας, όπου μια ακολουθία γονιδιώματος συγκρίνεται με άλλες γνωστές αλληλουχίες γονιδιώματος (με προκαθορισμένο όριο 90% για να θεωρηθεί «νέα» αλληλουχία), επιβεβαίωσαν ότι η αλληλουχία του γονιδιώματος αυτού του νέου ιού είναι 79.0% παρόμοιο με το SARS-CoV, περίπου 51.8% παρόμοιο με το MERS-CoV και περίπου 87.6-87.7% παρόμοιο με άλλα SARS που μοιάζουν με CoVs από κινέζικα νυχτερίδες πετάλου (που ονομάζονται ZC45 και ZXC21). Η φυλογενετική ανάλυση έδειξε ότι οι αλληλουχίες των πέντε στελεχών CoV που ελήφθησαν ήταν πλησιέστερες προς εκείνες των στελεχών που προέρχονται από ρόπαλο, αλλά σχημάτισαν ξεχωριστούς εξελικτικούς κλάδους. Αυτά τα ευρήματα δείχνουν σαφώς ότι ο ιός προήλθε από νυχτερίδες. Ο Δρ Wang λέει, «Επειδή οι ομοιότητες του γονιδίου της ιογενούς ρεπλικάσης με όλους τους άλλους γνωστούς «παρόμοιους» ιούς εξακολουθούν να είναι μικρότερες από 90%, και λαμβάνοντας επίσης υπόψη τα αποτελέσματα της φυλογενετικής ανάλυσης, θεωρούμε ότι αυτό είναι πράγματι ένα νέο, προηγουμένως άγνωστο CoV. Αυτός ο νέος ιός ονομάζεται προσωρινά το 2019-ncov."

Τέλος, οι επιστήμονες προχώρησαν στην «απομόνωση» του ιού από τα δείγματα υγρών BAL ελέγχοντας εάν τα δείγματα υγρών έδειξαν κυτταροπαθητική επίδραση στις κυτταρικές γραμμές στο εργαστήριο. Τα κύτταρα που εκτέθηκαν στα δείγματα υγρών παρατηρήθηκαν με ηλεκτρονικό μικροσκόπιο και οι επιστήμονες βρήκαν χαρακτηριστικές δομές τύπου CoV. Χρησιμοποίησαν επίσης ανοσοφθορισμό - μια τεχνική που χρησιμοποιεί ειδικά αντισώματα που φέρουν ετικέτες με φθορισμού βαφές. Για αυτό, χρησιμοποίησαν ορό από τους ασθενείς που αναρρούσαν (που περιείχαν αντισώματα), οι οποίοι αντέδρασαν με τα ιικά σωματίδια μέσα στα κύτταρα. Αυτό επιβεβαίωσε ότι αυτός ο ιός ήταν πράγματι η αιτία της μόλυνσης.

Αυτή η μελέτη ανοίγει το δρόμο για τις μελλοντικές μελέτες να κατανοήσουν καλύτερα τον ιό και τις πηγές του, ιδίως δεδομένης της ταχείας εξάπλωσής του, της ικανότητάς του να προκαλεί θανατηφόρο ARDS και του πανικού που προκαλείται από την εστία. Αν και 4 από τους 5 ασθενείς από τους οποίους εντοπίστηκε αυτός ο ιός ήταν από μια αγορά θαλασσινών στο Wuhan, η ακριβής προέλευση της λοίμωξης είναι άγνωστη. Το CoV θα μπορούσε να μεταδοθεί στον άνθρωπο μέσω ενός «ενδιάμεσου» φορέα, όπως στην περίπτωση του SARS-CoV (κρέας φοίνικα φοίνικα) ή του MERS-CoV (καμήλα). Ο Δρ Wang καταλήγει, «Όλα τα ανθρώπινα CoV είναι ζωονοσογόνα και πολλά ανθρώπινα CoV προέρχονται από νυχτερίδες, συμπεριλαμβανομένων των SARS και MERS-CoV. Η μελέτη μας δείχνει σαφώς την επείγουσα ανάγκη τακτικής παρακολούθησης της μετάδοσης CoV προέλευσης νυχτερίδας στον άνθρωπο. Η εμφάνιση αυτού του ιού είναι μια τεράστια απειλή για τη δημόσια υγεία και, ως εκ τούτου, είναι κρίσιμης σημασίας να κατανοήσουμε την πηγή αυτού του ιού και να αποφασίσουμε τα επόμενα βήματα προτού γίνουμε μάρτυρες μιας ευρύτερης κλίμακας. "